Hauptarbeitsfelder sind die Organisation der Kunstsammlungen (Graphische Sammlung, Handschriften, Inkunabeln, Kunstsammlungen) und des Leihverkehrs, Vorträge sowie Publikationen. Neuer Schwerpunkt ist die Forcierung und Intensivierung von externen Forschungsprojekten zum reichhaltigen Material in den Sammlungen, insbesondere in der Musikwissenschaft und der Frühneuzeit-Forschung (Donauuniversität, Ö. Akademie der Wissenschaften, Inst. f. Geschichtsforschung., Universität Wien) sowie die Aufarbeitung der Sammlungsgeschichte während der Zeit des Zweiten Weltkrieges, als die Göttweiger Sammlungen enteignet wurden.